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q：为什么要研究膜蛋白质组？

人类蛋白质中有1/3是膜蛋白，很多重要的生物学过程发生在膜上进行。膜蛋白是很多药物的靶点，信号分子的靶点，激酶。目前所注释到的药物靶点中，以膜蛋白作为药物靶点的比例在50%以上，最后应用到药物的研发以及到最后的治疗当中具有很重要的意义。
q：为什么研究膜蛋白质组的时候需要对膜蛋白进行分离，不直接用常规蛋白组的方法检测，生物信息分析的时候对膜蛋白进行分析？

1）膜蛋白在细胞中虽然种类很多，但是膜蛋白很多都是一些atp或者gtp偶联蛋白，酶蛋白，通道蛋白等，这一类蛋白功能很重要但是通常情况下丰度并不高，如果不经常富集上质谱，信号很容易被细胞中其他高丰度蛋白掩盖；而通过富集的操作，可以增加组分中膜蛋白的比例，削弱其他蛋白对膜蛋白信号的影响，从而鉴定到更多膜蛋白。

2）膜蛋白本身大多数是疏水性的蛋白，如果不通过富集，在蛋白提取时得率很低；富集可以提高膜蛋白的得率，从而达到增加鉴定数目的目的。
q：膜蛋白提取方法有哪些？

1）超速离心，特点处理量大，成分复杂时离心次数多易损失；

2）密度梯度离心，单次可得到多个组分，样品处理时间长；

3）试剂盒，操作简单无需特殊设备，不同样本提取有差异；

4）抗体免疫磁珠，特异性好，纯度高，成本高

5）生物素，只能分离外膜蛋白，成本高。