翻译后修饰蛋白组

组蛋白翻译后修饰|蛋白翻译|蛋白质翻译表达 -凯发k8网页登录

  • 磷酸化蛋白组
  • 乙酰化蛋白组
  • 泛素化定量蛋白质组学
  • 甲基化定量蛋白质组学

服务特色

蛋白质翻译后修饰(ptms)几乎参与了细胞所有正常生命活动的过程,在信号转导和调控中发挥十分重要的作用。蛋白修饰已经成为国际上蛋白质研究的一个极其重要的领域。金开瑞结合先进的lc-ms/ms系统分析和生物信息学分析技术,提供磷酸化、乙酰化等蛋白质修饰鉴定和定量技术服务。

服务介绍

磷酸化定量蛋白质组学:

蛋白质磷酸化是生物体中最常见、最重要的一种蛋白质翻译后修饰方式,它可以通过激发、调节诸多信号通路进而参与调控生物体的生长、发育、逆境应激、疾病发生等多种生命过程,所以磷酸化一直是生物学研究的重点与热点。磷酸化蛋白质组 (phosphoproteomics)以组织、细胞等较为复杂样本为研究对象,目的在于鉴定样品中发生磷酸化的蛋白质以及相应的磷酸化位点。

乙酰化定量蛋白质组学:

蛋白质的乙酰化修饰是在乙酰基转移酶的作用下,蛋白质的赖氨酸残基上添加乙酰基的过程,是细胞控制基因表达、蛋白质的活性或生理过程的一种机制。乙酰化主要集中在对细胞染色体结构的影响以及对核内转录调控因子的激活方面,还参与细胞周期和新陈代谢、肌动蛋白聚合控制。乙酰化蛋白质组以组织、细胞等较为复杂样本为研究对象,目的在于鉴定样品中发生乙酰化的蛋白质以及相应的乙酰化位点。

泛素化定量蛋白质组学

蛋白质泛素化修饰是一种在细胞内广泛存在的重要蛋白质翻译后修饰方式。这种修饰通过连接泛素分子到目标蛋白上,调控蛋白质的功能、稳定性和位置,参与多种细胞生物学过程,包括蛋白质降解、细胞周期调控、dna修复和信号转导等。泛素化定量蛋白质组学以复杂样本如细胞、组织等为研究对象,目的在于鉴定样品中发生泛素化修饰的蛋白质以及相应的泛素化修饰位点。

乳酸化定量蛋白质组学

蛋白质乳酸化修饰是一种新近发现的蛋白质翻译后修饰方式,涉及将乳酸基团添加到蛋白质的赖氨酸残基上,是一种重要的代谢修饰方式。乳酸化定量蛋白质组学以组织、细胞等较为复杂样本为研究对象,目的在于鉴定样品中发生乳酸化修饰的蛋白质以及相应的乳酸化修饰位点。

甲基化定量蛋白质组学

蛋白质甲基化修饰是一种常见的蛋白质翻译后修饰方式,涉及在蛋白质上添加甲基基团,通过酶催化反应在赖氨酸、精氨酸或其他氨基酸残基上引入甲基化修饰。甲基化定量蛋白质组学以组织、细胞等较为复杂样本为研究对象,目的在于鉴定样品中发生甲基化修饰的蛋白质以及相应的甲基化修饰位点。

服务优势

  • 全面解析修饰类型:翻译后修饰蛋白组学可以全面解析蛋白质的不同类型的翻译后修饰,包括磷酸化、乙酰化、泛素化、甲基化等多种修饰,帮助揭示蛋白质的多样化功能。
  • 高通量技术:该凯发k8网页登录的技术支持高通量样本处理,能够同时分析多个样本,加快研究进程,提高实验效率。
  • 高灵敏度和准确性:该技术采用高分辨质谱仪进行分析,具有高灵敏度和准确性,能够检测低丰度修饰蛋白质,并提供可靠的定量信息。
  • 大规模数据分析:翻译后修饰蛋白组学能够进行大规模数据分析,处理复杂的样本,识别大量的修饰位点,为深入研究蛋白质功能和调控提供全面的信息。
  • 个性化定制:根据不同研究目的,可以定制化实验方案,针对不同样本类型和修饰类型进行研究,满足客户的个性化需求。

服务流程

接受订单及样品
蛋白提取
蛋白酶解
修饰肽段富集
lc-ms/ms
数据解析
结果交付

客户提供

需鉴定的样品;

样品信息单:需详细填写样品来源、含量、状态及其他基本信息。

最终交付

  • 实验报告一份,含具体实验流程及蛋白质组鉴定及定量结果(生物信息学分析)。
  • 生物信息学分析内容包括: 1. 修饰蛋白、修饰位点鉴定; 2. 鉴定结果特征分布:肽段长度、蛋白覆盖度分布、unique肽段分布; 3. 修饰位点motif预测; 4. 蛋白质go功能分类、cog注释、pathway通路注释; 5. 蛋白质网络互作预测;

服务说明

平台

产品类型

项目周期

技术指标

样本数量(单次送样个数)

3d平台

tmt 磷酸化蛋白组学

30个自然日

thermo q exactive hf(x)系统

不少于6个样

tmt 甲基化组学(精氨酸甲基化)

35个自然日

tmt 乙酰化蛋白组学

30个自然日

tmt 乳酸化蛋白组学

35个自然日

lfq 乳酸化蛋白组学

30个自然日

4d平台

4d 泛素化label free

30个自然日

tims tof pro

<20

20≤x≤50

>50

4d 乙酰化label free

30个自然日

tims tof pro

<20

20≤x≤50

>50

4d 磷酸化label free

40个自然日

tims tof pro,默认tio2富集,可选imac。

<20

20≤x≤50

>50

相关技术服务

蛋白鉴定                                ● 4d dia定量蛋白组            ● itraq/tmt定量蛋白组

● label-free定量蛋白组            ● prm                                 ● 糖蛋白质组学分析服务

相关资源

1、翻译后修饰蛋白组学在生物学和医学研究中有广泛的应用

    ● 蛋白质功能研究:通过分析蛋白质的翻译后修饰,可以揭示蛋白质的功能和调控机制,包括信号传导、细胞周期调控、代谢途径等。

    ● 生物标志物发现:翻译后修饰蛋白组学可以发现与疾病相关的生物标志物,用于疾病早期诊断和治疗监测。

    ● 药物开发:对药物靶点蛋白的翻译后修饰进行研究,有助于优化药物设计和开发更有效的治疗药物。

    ● 细胞信号通路研究:通过翻译后修饰蛋白组学,可以深入了解细胞信号通路的调控机制和相互作用。

    ● 癌症研究:翻译后修饰蛋白组学在癌症研究中具有重要意义,可以揭示肿瘤发生和发展过程中的蛋白质修饰变化,为癌症治疗提供新的靶点和策略。

    ● 细胞代谢调控:翻译后修饰蛋白组学有助于研究细胞代谢调控的机制,对代谢性疾病如糖尿病等的研究具有重要意义。


2、蛋白翻译后修饰功能简介(部分示例)

修饰类型

英文名称

修饰功能

磷酸化

phosphorylation

调节蛋白酶活性,信号传导,细胞增殖和凋亡

乙酰化

acetylation

调节蛋白稳定性,转录调控,基因表达和细胞周期

泛素化

ubiquitination

调节蛋白降解,细胞周期调控,dna修复和膜蛋白定位

甲基化

methylation

调节基因表达,蛋白亚细胞定位,染色质结构和细胞分化

糖基化

glycosylation

调控蛋白折叠,稳定性,细胞信号传导和病毒入侵

琥珀酰化

succinylation

调节蛋白降解,信号传导,基因表达和dna修复

巴豆酰化

butyrylation

调控蛋白稳定性,转录活性,细胞周期和细胞分化

乳酸化

lactylation

调节蛋白功能,能量代谢,细胞信号传导和代谢途径调控

甲基丙烯酰化

malonylation

调节蛋白功能和相互作用,影响细胞增殖,转录和细胞周期

硝化

nitrosylation

调节蛋白酶活性,信号传导,细胞凋亡和免疫反应

脂肪酰化

palmitoylation

调节蛋白稳定性,细胞信号传导,细胞周期和细胞凋亡

丙二醛化

propionylation

调节蛋白稳定性,细胞凋亡,抗氧化应激和细胞信号传导

泛素样修饰

sumoylation

调节蛋白酶活性,蛋白降解,细胞凋亡和dna损伤修复

丝氨酰化

serotonylation

调节蛋白功能,dna损伤应答,细胞周期和细胞增殖

硫化

sulfhydration

调节蛋白稳定性,氧化还原平衡,细胞凋亡和细胞周期

硝酸化

nitrosation

调节蛋白稳定性,细胞信号传导,细胞增殖和免疫应答

溴化

bromination

调节蛋白功能,dna损伤修复,细胞周期和细胞增殖

磷酸胆碱化

phosphocholination

调节蛋白稳定性,信号传导,细胞增殖和细胞凋亡

戊酰化

glutarylation

调节蛋白稳定性,细胞信号传导,细胞增殖和细胞凋亡

丙二酰化

propionylation

调节蛋白功能和相互作用,影响细胞增殖,转录和细胞周期

丁酸化

butyrylation

调控蛋白稳定性,转录活性,细胞周期和细胞分化

苯甲酰化

benzoylation

调节蛋白功能,信号传导,细胞凋亡和dna损伤修复

 

3、蛋白修饰如何确认?

蛋白修饰的确认方法可以分为多种技术,其中一些常见的方法包括:

    ● 质谱分析:质谱是一种高效准确的蛋白修饰鉴定方法,包括磷酸化、乙酰化、泛素化、甲基化等。质谱可以通过检测质谱峰的质量和相对丰度来确定修饰位点和修饰类型。

    ● 免疫检测:使用特异性抗体来检测特定的蛋白修饰,例如磷酸化、乙酰化等。western blot免疫组织化学是常用的免疫检测方法。

    ● 电泳分析:蛋白质电泳分析可以用于检测蛋白质泛素化、泛素链的长度和形态等修饰。

    ● 核磁共振谱(nmr):nmr可以用于解析蛋白质的三维结构,从而确定是否存在特定的修饰。

    ● 序列分析:通过分析蛋白质序列中特定的修饰位点,结合生物信息学工具,可以预测可能的修饰类型。

    ● 酶消化:使用特定酶来消化蛋白质,从而鉴定修饰位点。

    ● 结构生物学方法:如x射线晶体学、冷冻电镜等可以揭示蛋白质的结构,帮助解析修饰的位置和类型。

    不同的蛋白质修饰可能需要不同的确认方法,研究人员根据具体的研究问题和修饰类型选择合适的方法来确认蛋白质修饰。综合运用多种技术可以更全面地了解蛋白质修饰的类型和功能。

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