荧光定量pcr(qrt-pcr)

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  • 快速分析
  • 高灵敏度
  • 实时定量
  • 基因表达分析

服务特色

荧光定量pcr(qrt-pcr)是一种实时监测和定量目标dna序列丰度的技术,广泛应用于基因表达分析、病原体检测和突变分析等领域。

服务介绍

实时荧光定量pcr(real-time quantitative pcr)/qrt-pcr,是指在pcr反应体系中加入荧光标记物,利用荧光信号积累实时监测整个pcr进程,最后通过扩增曲线对未知模板进行定量分析的方法。一般用于mrna转录水平的定量研究、不同样本或基因组中dna拷贝数的测定、基因芯片结果验证、药效分析等。

服务优势

  • 高灵敏度和高特异性:通过荧光信号的实时监测,可以精确定量目标dna序列的丰度,具有高灵敏度和高特异性。
  • 快速和高通量:qrt-pcr反应时间相对较短,可以在较短时间内完成大量样品的分析,适用于高通量实验。
  • 定量范围广:qrt-pcr可以在非常低的目标dna浓度范围和非常高的目标dna浓度范围内进行定量,具有广泛的定量范围。
  • 可靠性和准确性:通过内部标准和质量控制,可以减少样品间和批次间的变异性,提高结果的可靠性和准确性。
  • 多功能性:qrt-pcr可以应用于基因表达分析、病原体检测、突变分析、mirna研究等多个研究领域,具有广泛的应用潜力。

服务流程

接收订单及样品
rna提取
rna质量检测
样品cdna合成
定量试验
数据分析
结果交付
凯发k8网页登录的售后服务

客户提供

样品及尽可能详细的背景信息(如物种信息,扩增目的基因ncbi登录号,相关文献和样品来源等)。

样品:组织应不少于100 mg;

细胞10^6-10^7个细胞;

细胞或组织裂解液总rna浓度须大于1 mg/ml,单个样品不少于50 μl;

cdna不少于30 μg。

(组织需液氮速冻、细胞收获后加入trizol保存于-80度。样品用干冰寄送。避免各类污染和反复冻融。)

最终交付

  • 溶解曲线、ct值及完整实验报告;
  • 实验报告内容包括所提取rna浓度、荧光定量pcr原始数据及分析结果;
  • 荧光定量pcr完整的实验步骤、使用仪器、软件设置参数等。

服务说明

服务名称 服务内容 服务周期(工作日)

荧光定量pcr

(real-time qpcr)

普通引物合成(客户提供特异性序列) /
普通引物设计 合成 特异性筛选 3-5个
lncrna、circrna设计 合成 特异性筛选 6-8个
microrna引物(客户提供颈环和qpcr特异性序列) 12-16个
microrna颈环引物设计 合成 特异性筛选 12-16个
rna提取及逆转录 2-3个
荧光定量pcr(不限rna种类) 实际样品数量来定

相关资源

1、荧光定量pcr(qrt-pcr)的实验步骤

    ● rna提取:从样品中提取rna,确保rna的质量和纯度。常用的rna提取方法包括酚/氯仿法、硅胶膜柱法等。

    ● cdna合成:使用逆转录酶(reverse transcriptase)将rna转录成cdna。反转录反应中需要引物(primers)、逆转录酶和逆转录缓冲液。反转录酶会合成相应的cdna,该cdna包含了rna样品中的目标序列。

    ● qpcr反应设置:将反转录产生的cdna与引物和荧光探针(如taqman探针、sybr green探针)一同加入pcr反应混合物中。引物是专门设计的dna片段,用于特异性扩增目标序列。荧光探针可以结合到扩增产物上,发出荧光信号。

    ● pcr扩增:通过多个循环的温度变化,即pcr扩增过程,使目标序列在dna模板中进行扩增。pcr反应的循环包括变性(denaturation)、退火(annealing)和延伸(extension)阶段。

    ● 荧光检测:在pcr反应的延伸阶段,荧光探针会与目标序列结合,发出荧光信号。这些信号可以通过荧光检测仪器实时监测。

    ● 数据分析:通过荧光信号的强度和pcr循环数,可以计算出目标序列的初始量或相对丰度。数据分析方法包括阈值循环数(ct)法、标准曲线法等。

 

2、qrt-pcr实验结果不如预期可能的原因以及相应的凯发k8网页登录的解决方案

实验结果不如预期

可能的原因

凯发k8网页登录的解决方案
低信号强度或不可检测的信号

样品中的目标rna浓度过低

检查rna提取方法和效果,重新提取样品或调整稀释倍数

引物或探针的设计问题

重新设计引物或探针,确保与目标序列的特异性

pcr反应条件不合适

优化pcr反应条件,调整温度和时间以提高扩增效率和信号强度
高背景噪音或非特异信号

引物或探针的特异性问题

重新评估引物或探针的特异性,确保与目标序列的特异性

污染或污染物干扰

检查实验室环境和试剂纯净性,确保实验无菌和无污染
异常的ct值或差异表达结果

实验重复性问题

增加实验重复次数,提高实验的重复性

数据处理问题

审查数据处理方法和参数,确保分析的准确性

样品异质性

分析样品中的异质性来源,如细胞亚群的存在或组织中不同细胞类型的混合

 

3、qrt-pcr在生物学和医学研究中一些具体的应用领域和示例:

    ● 基因表达分析:qrt-pcr可以用于定量测量基因的表达水平,帮助研究人员了解基因在不同条件下的变化。例如,可以使用qrt-pcr分析药物处理后特定基因的表达变化,如药物治疗后癌症相关基因的表达调控。

    ● 病原体检测:qrt-pcr可用于检测和定量病原体(如病毒、细菌等)的存在和数量。例如,在临床实践中,可以使用qrt-pcr检测病毒感染,如covid-19病毒的检测。

    ● 突变分析:qrt-pcr可以用于检测和定量dna序列上的突变或多态性。例如,在遗传疾病研究中,可以使用qrt-pcr分析突变基因的表达变化,进一步了解突变对基因功能和疾病发展的影响。

    ● mirna研究:qrt-pcr可以用于定量测量microrna(mirna)的表达水平,揭示mirna在基因调控和疾病发生中的作用。例如,可以使用qrt-pcr分析特定mirna在肿瘤中的表达变化,研究其与肿瘤发展的关系。

    ● 表观遗传学研究:qrt-pcr可用于研究dna甲基化和组蛋白修饰等表观遗传标记的变化。例如,可以使用qrt-pcr分析特定组蛋白修饰酶的表达水平,探索其在表观遗传调控中的作用。

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