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【支招】膜体系酵母双杂载体怎么选?
文章来源:genecreate 作者:genecreate 发布时间:2022-01-19 21:14

书接上文,上回我们聊到了,这期我们来唠一唠膜体系酵母双杂载体怎么选择

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dual membrane 系统(dual membrane system)首先由瑞士的dualsystems biotech ag 公司开发出来,是基于分离的泛素(split-ubiquitin)介导的膜蛋白酵母双杂交系统。可介导蛋白降解的泛素(ubiquitin)被分为:

①cub(c端结构域)

②nub(n端结构域):第三位的i被突变为g得到nubg,nubg在bait和prey互作下结构重构,与cub发生互作

 

膜蛋白酵母双杂交-dualsystems split ubiquitin原理是:

cub与lexa-vp16转录激活因子连接成cub-lexa-vp16,当bait-cub-lexa-vp16与prey-nubg可互作时,cub与nubg在空间上接近发生重构,被泛素特异性蛋白酶ubps识别,lexa-vp16被解离进入核内,使启动子下游基因(抗性筛选、蓝白斑筛选、营养缺陷型筛选等)得到转录。

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膜体系酵母双杂选择载体是根据诱饵蛋白质定位的不同来选择,有利于互作蛋白相连的泛素nubg和cub-lexa-vp16相互作用,被ubps识别,从而启动下游报告基因表达。主要分为以下几种情况:

1. 若诱饵蛋白的n端在胞质,c端在细胞器腔内(或者胞外),建议用pbt3-n载体构建诱饵。

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2. 若诱饵蛋白是c端位于胞质,n端位于细胞器腔内(或者胞外),且n端含有信号肽,选择载体pbt3-suc构建诱饵重组质粒,这是因为某些哺乳动物细胞的信号肽在酵母中无法识别,而pbt3-suc中含有一段酵素转化酶(suc2)基因序列,当其定位在诱饵蛋白n端,能够确保诱饵蛋白正确定位到酵母细胞膜上。

 

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图片来源于dual membrane pairwise interaction kit user manual

 

从载体的图谱上中可以看出,cdna插入位点(sifi位点)的上游是suc2,下游是cub-lexa-vp16。这样表达后诱饵蛋白n端就含有suc, c端含有cub-lexa-vp16,诱饵蛋白就能够定位在膜上,并且和互作蛋白的nubg相互作用。

 

3. 若诱饵蛋白是c端在胞质,n端在细胞器腔内(或者胞外),且n端不含信号肽,推荐使用pbt3-ste。

 

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4. 如果你的诱饵蛋白n端c端均位于胞质,则pbt3-n和pbt3-ste都可以选择。

 

5. 膜体系的猎物(prey)载体分别为ppr3-n和ppr3-c。nubg在猎物蛋白n端时建议用ppr3-n。nubg在猎物蛋白c端时采用建议用ppr3-c。

 

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