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长链非编码rna(lncrna)研究-凯发k8网页登录

服务简介

长链非编码rna(long noncoding rna, lncrna)指的是长度超过200nt的rna分子。它们不编码蛋白,位于细胞核或胞质内,具有保守的二级结构,可与蛋白质、dna和rna相互作用,通过多种机制(如基因印记、染色质重塑、细胞周期调控、剪接调控、mrna降解和翻译调控等)在多种层面上(如表观遗传学、转录调控及转录后调控等)调控基因的表达水平。

lncrna参与多种生物学过程的调控,在多种生命活动中发挥重要作用,该领域的关注度也日益增高,已成为继信使rna(mrna)、小rna(microrna、sirna等)之后功能基因组学最火热的研究领域。

服务内容

金开瑞现提供下述lncrna研究服务:

1、确定lncrna表达

利用q-pcr技术检测lncrna在不同组织中的表达水平。

2、探究lncrna特点

(1)通过qd-fish原位杂交技术定位;或者通过细胞核质分离试剂盒得到rna,qrt-pcr检测其分布;

(2)全长序列试验方法:通过race得到lncrna完整的全长序列。

3、lncrna的功能研究

lncrna较长,承载的信息量多,更容易形成高级结构,其功能具有多样化和特异性强的特点。类似于mirna,探讨lncrna功能可用 gain/loss of function 策略,过表达或沉默lncrna后观察表型。即研究lncrna功能获得后或者功能缺失后对细胞增殖、凋亡、侵袭、转移与克隆形成,以及病毒的转录复制等的影响。

(1)功能获得性研究

构建lncrna过表达质粒或者慢病毒、腺病毒包装载体。

(2)功能缺失性研究

sirna、shrna、crispr/cas9。

4、检测结合蛋白质

利用体外转录,rna pull down, ms等技术手段检测与rna绑定的蛋白质。

5、预测并验证作用的mirna

利用软件预测mirna在lncrna的作用靶点,并进行验证。

6、表达调控

将lncrna表达与其他领域相结合,解释其调控机理。(1)dna甲基化和乙酰化:可通过检测相应基因甲基化、乙酰化差异与lncrna结合分析。(2)转录因子:研究lncrna与转录因子的调控机制。

如何订购

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